微波干燥杀菌设备在食品领域之中占据了重要的地位，它可以快速的对食品进行干燥杀菌，并且不会改变食品原有的风味，延长其保质期和方便运输。它的还可用于木材、药材和纸制品等行业之中，都有着理想的效果，受到了不少消费者的喜爱。
不过，微波干燥设备也有无法涉及的领域。对于需要干燥的物料温度不能太高的产品就不适合微波干燥杀菌设备，比如干燥瓜果，因为这些产品之中的含水量很高，容易积热，但是物料本身又不允许温度高所以也不能用微波设备。微波干燥设备不适合带有金属的特料，因为金属的特性是反射微波，所以带有金属的物料放到微波干燥设备里面，就算物料能干燥，但其干燥的均匀性也不无法控制的。
